JGraph har funnits ett tag men har gjorts om i grunden till JGraphX (för Java) och även porterats till JavaScript och heter då mxGraph. Kraftfullt och snyggt blir det. Här en demosajt för mxGraph: http://www.diagram.ly/
Forum för både JGraphX och mxGraph: http://forum.jgraph.com/
Bra är dessutom att mycket är gemensamt mellan dessa reinkarnationer.